我国内脏利什曼病有三种流行类型，致病利什曼原虫虫株均属于杜氏利什曼原虫复合体。我国内脏利什曼病在感染人群、疾病潜伏期和动物宿主等方面的差异机制尚不清楚。我们研究了我国三种内脏利什曼病流行区分离的利什曼原虫株（KS-2、JIASHI-5和SC6）的蛋白质丰度差异。采用液相色谱-电喷雾串联质谱（LC-ESI-MS/MS）对胰蛋白酶消化液进行分析，然后进行无标记定量分析。在Q精密质谱仪上进行了质谱实验。用MaxQuant软件（ver1.3.0.5）对原始光谱进行定量分析，并与参考数据库进行比对。用生物信息学方法分析差异表达蛋白。对每个样品重复进行三次质谱分析。在KS-2、JIASHI-5和SC6株中检测到5012个蛋白。其中在2个株间至少有1758差异表达的蛋白，其中349个蛋白为已知蛋白。这些已知的差异表达蛋白涉及能量和脂质代谢过程、核苷酸代谢过程、氨基酸代谢过程、应激反应、细胞膜/细胞骨架、细胞周期和增殖、生物粘附和蛋白水解、定位和转运等生物学功能，生物过程的调节和信号转导。利什曼原虫差异表达蛋白及其相关生物学功能可能为利什曼原虫的致病性研究和疫苗、药物的开发提供依据。

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