隐孢子虫是一类可感染人类及多种动物的肠道原虫，具有重要的人兽共患意义。山羊被认为是隐孢子虫的重要宿主，但在我国部分地区，其在隐孢子虫传播中的流行特征仍缺乏系统认识。为此，本研究以中国浙江省为研究区域，系统调查山羊隐孢子虫的感染情况及虫种分布。本研究在浙江省多个养殖场共采集山羊粪便样本386份，提取基因组DNA，通过PCR扩增核糖体小亚基RNA（SSU rRNA）基因进行隐孢子虫检测，结合一代测序进行虫种鉴定。对微小隐孢子虫、肖氏隐孢子虫和泛在隐孢子虫阳性样本，进一步通过基于60 kDa糖蛋白（gp60）基因进行亚型分析。结果显示，386份山羊粪便样本中共有31份为隐孢子虫阳性，总感染率为8.0%。共鉴定到4个隐孢子虫虫种，分别为肖氏隐孢子虫（n = 14）、泛在隐孢子虫（n = 12）、微小隐孢子虫（n = 3）和奇异隐孢子虫（n = 2）。gp60亚型分析进一步鉴定到肖氏隐孢子虫XXIIIa亚型、泛在隐孢子虫XIIa亚型及微小隐孢子虫IIdA19G1亚型。值得关注的是，本研究鉴定出的微小隐孢子虫和泛在隐孢子虫均为人兽共患虫种，既往已在人类和啮齿动物中报道，提示该地区可能存在潜在的跨宿主传播风险。山羊在隐孢子虫环境污染及人兽共患传播过程中可能发挥重要的作用。因此，加强山羊养殖过程中的粪便管理措施和卫生处理，对于降低隐孢子虫传播风险、预防其暴发具有重要意义。

  本研究已于2026年1月7日在线发表在《BMC Microbiology》（DOI：10.1186/s12866-025-04668-z）。

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